噴灌系統安裝大體可分為八個步驟：開溝挖槽、安裝管道、水壓試驗、溝槽回填、安裝噴頭、安裝加壓設備、其它設備安裝、系統調試。各部分安裝過程中需注意的問題如下：
一、開溝挖槽：溝槽深度需滿足設備安裝、外部承壓和冬季泄水的要求；溝槽盡量窄些；溝槽應順直，槽床坡度盡量向這閥門井或泄水井；挖出的土可在管溝一側分層堆放；溝槽內不應有堅硬雜物；需挖掘過路溝時，溝槽深度應符合路基承壓要求。
二、安裝管道：安裝前需檢查管材管件，排除變形、裂紋、破損的產品；橫管和槽床要結合良好，不要懸空；豎管的安裝角度要符合設計要求；多管同溝時，盡量避免不同管道搭接交叉；管網工作壓力較大時，盡量對彎頭、三通等部件進行混凝土墩加固處理。
三、壓力測試：壓力測試是管道安裝工作中是比較重要的一個環節，為的是檢測管道連接密的閉性。在進行試驗時，應按以系統設計的工作壓力確定測試壓力，嚴格按照有關技術規范進行試驗并做好試驗記錄。在試驗過程中，在進行打壓和衡壓測試時，注意遠離閥門和管件部位。
四、溝槽回填：管道的壓力測試合格后就可以回填溝槽了。先回填約10cm厚沙土，然后分層夯填。如果挖出的土是分層堆放的，回填時也應按順序分層回填。
五、安裝噴頭：噴頭安裝前應注水沖洗所有干管、支管進行，清除管內的泥沙和異物，避免雜物堵塞噴頭。噴頭高度應與地面平齊；灌區邊界和特殊點噴頭的安裝位置應考慮定位的合理性，以防出現漏噴或噴灑出界的問題。
六、安裝加壓設備：加壓設備是加壓型噴灌系統的心臟，若發生故障，整個噴灌系統將癱瘓，在安裝時，必須小心謹慎。常用的加壓設備有各類水泵和恒壓供水裝置。水泵安裝時應考慮其工作時的穩定性，選用適宜的基礎，混凝土結構一般可作為理想的灌溉用水泵基礎。在靠近水泵入口的地方要安裝真空表，靠近出口處安裝壓力表以檢查水泵的運行狀況。安裝的電機應與使用的水泵配套，并選用適合的電纜進行連接。
七、其它設備安裝：其它設備是指各種手動和自動閥門、控制器、傳感器等控制和輔助設備。這類設備在安裝的時候，應仔細閱讀安裝說明和注意事項，選用適合的導線安裝完成后還要對安裝接頭做好防水處理。
八、系統調試：在整個的系統的安裝完成以后，需要按照設計和設備技術文件規定對系統進行調整等測試，在測試結果達標后方能正式交付使用。
